ATHALLAHARIQ, MUHAMMAD (2023) SELEKSI MARKA MOLEKULAR SPESIFIK GEN Pik DALAM PENGEMBANGAN PADI VARIETAS CIHERANG TAHAN TERHADAP PENYAKIT BLAS. S1 thesis, UNIVERSITAS SULTAN AGENG TIRTAYASA.
![[img]](https://eprints.untirta.ac.id/style/images/fileicons/text.png) |
Text (BAB 2)
Muhammad Athallahariq_4442180023_02.pdf Restricted to Registered users only Download (465kB) | Request a copy |
|
Text (BAB 3)
Muhammad Athallahariq_4442180023_03.pdf Restricted to Registered users only Download (401kB) | Request a copy |
|
Text (BAB 4)
Muhammad Athallahariq_4442180023_04.pdf Restricted to Registered users only Download (613kB) | Request a copy |
|
Text (BAB 5)
Muhammad Athallahariq_4442180023_05.pdf Restricted to Registered users only Download (175kB) | Request a copy |
|
Text (REFERENSI)
Muhammad Athallahariq_4442180023_Ref.pdf Restricted to Registered users only Download (549kB) | Request a copy |
|
Text (LAMPIRAN)
Muhammad Athallahariq_4442180023_Lamp.pdf Restricted to Registered users only Download (665kB) | Request a copy |
|
Text (SKRIPSI)
Muhammad Athallahariq_4442180023_Fulltext.pdf Restricted to Registered users only Download (2MB) | Request a copy |
|
Text (COVER-BAB 1)
Muhammad Athallahariq_4442180023_01.pdf Restricted to Registered users only Download (960kB) | Request a copy |
Abstract
Agriculture plays a major role in the development of a country. Therefore the issue of biotics and abiotics of plants will be an important issue because it can affected social problems that play a role in food resistance. Especially when staple crops affected. Rice is one of the plants that is widely used as a staple crop in several countries in Asia. Who is currently experiencing a great deal with blast diseases. The formation and development of plant varieties is an important step to slow down the development of new blast races. In line with that, the search for molecular markers specific to blast resistance gene is also important. The purpose of this research is to obtained polymorphic markers and specific to Pik gene for selection the process in plant populations that are resistance to blast diseases resistance in paddy crops. The analysis is carried out by several methods, firstly we used gel analyzer to screening twenty five primers that spesific to Pik gene and then the primers obtained were reselected use resistant and susceptible DNA populations. At the screening stage of variety Ciherang and IRBl Kp-K60 we got twenty five primers that successfully show clear bands, and twelve of them can be used for the validation stage in BC3F1 offspring. At this stage as much as one primer that can be used for population selection BC3F1 that is SNP k8824-1 this primer can be used to identified the presence of the Pik-p gene
| Item Type: | Thesis (S1) | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Contributors: |
|
||||||||||||
| Additional Information: | Penyakit blast yang disebabkan oleh jamur Pyricularia grisea Sacc. merupakan salah satu penyakit yang menyerang tanaman padi dan telah menjadi perhatian penting di berbagai negara karena kerusakaannya sangat luas, dapat bermutasi menjadi ras-ras yang lebih adaptif sehingga berefek pada patahnya sifat ketahanan tanaman. Pembentukan dan pengembangan varietas tanaman merupakan suatu langkah yang penting untuk dapat memperlambat perkembangan ras blas baru, dan pendekatan melalui molekular dapat mempercepat proses penyeleksian tersebut. Tujuan penelitian ini untuk mendapatkan marka yang polimorfik dan terpaut gen Pik pada tetua tanaman padi Ciherang dan IRBl Kp-K60 yang dapat digunakan untuk menyeleksi keturunan hasil backcrossing. Penelitian ini dilakukan dengan menggunakan metode deskriptif dengan pendekatan kualitatif dan telah dilaksanakan di laboratorium genomik, Pusat Riset Bioteknologi Badan Riset dan Inovasi Nasional (BRIN) Cibinong Bogor pada bulan Februari 2022 sampai dengan September 2022. Yaitu dengan cara mengevaluasi primer-primer dari berbagai tipe marka melalui dua tahapan, pertama dilakukan seleksi sebanyak 25 primer dari jenis SSR, SNP, CAPS dan InDel. Sebanyak 12 primer yang berhasil terseleksi kemudian diseleksi kembali menggunakan tanaman padi kontrol tahan dan rentan terhadap penyakit blas. Hasil penelitian menunjukkan bahwa marka SSR menghasilkan dua jenis pola pita yaitu polimorfik kodominan dan monomorfik masing-masing berjumlah tujuh primer dan dua primer, marka InDels menghasilkan satu jenis pola pita yaitu polimorfik kodominan sebanyak dua primer, marka CAPS menghasilkan pola pita yang berbentuk polimorfik dominan yaitu berjumlah satu dan polimorfik kodominan berjumlah dua, serta marka SNP menghasilkan pola pita yang berbentuk polimorfik dominan yaitu sebanyak lima primer, polimorfik kodominan berjumlah dua, dan monomorfik berjumlah empat. | ||||||||||||
| Uncontrolled Keywords: | Blast resistance, Ciherang, IRBL Kp-K60, molecular markers, Pik gene. | ||||||||||||
| Subjects: | S Agriculture > S Agriculture (General) | ||||||||||||
| Divisions: | 04-Fakultas Pertanian 04-Fakultas Pertanian > 54211-Program Studi Agroekoteknologi |
||||||||||||
| Depositing User: | MUHAMMAD ATHALLAHARIQ | ||||||||||||
| Date Deposited: | 20 Feb 2025 02:25 | ||||||||||||
| Last Modified: | 20 Feb 2025 02:25 | ||||||||||||
| URI: | http://eprints.untirta.ac.id/id/eprint/45826 |
Actions (login required)
 |
View Item |